FreeMind está escrito en Java, por lo que funcionará en casi cualquier sistema que lo utilice.
Podemos elegir para los sistemas operativos más comunes (Windows, Linux y Macintosh OS X) una instalación mínima, que nos ofrece sólo el paquete básico FreeMind o instalar una máxima, que incluye plugins para Scalable Vector Graphics (SVG), Portable Document Format (PDF), los recordatorios y archivos de ayuda.
Antes de instalar FreeMind, debemos poseer Java Runtime Environment 1.6 o posterior. Sino lo tenemos, podemos encontrarlo en Java Sun.